Kui nakatunud tsetse lendab inimesi, süstitab see transkutaanselt süljenäärmetes esinevaid metatsüklilisi tripomastigoteid . Peremeesorganismisse sisenedes sisenevad parasiidid lümfisüsteemi ja vereringesse, kus nad muutuvad ringlevateks tripomastigootideks ja alustavad binaarsete lõhenemistega (hemolümfaatiline staadium) pidevat paljunemist.
Parasitemia on perioodiline: hetked, kus see on tõusnud vaheldumisi teistega, kus nakatunud organism on spetsiifiliste antikehade tekitamise tõttu järsult vähenenud. Parasiitide rühm, aga ka pindglükoproteiinide modifitseerimise abil, on võimeline vältima antikeha vastust. Seetõttu korratakse korrutust ja lüüsi tsüklit.
Hiljem nakatumise käigus tungivad trüpanosoomid lümfisõlmedesse, põrnasse, maksasse ja paljudesse teistesse elunditesse. Surm võib tekkida paar päeva pärast kesknärvisüsteemi ( meningo-entsefalitiline staadium ) osalemist.
Tsükkel säilitatakse siis, kui tsetse lendab nakatunud inimese või looma verd. Vektoris korduvad algloomad soolestikus, enne kui nad rändavad putuka süljenäärmetesse. Tse-tse lend võib infektsiooni edastada teisele imetajale või inimesele uue nõelaga, kui nakatumisest on möödunud vähemalt 20-30 päeva.
