Kõigil isikutel, kes on jäänud haiguse ohus olevatesse Aafrika piirkondadesse, tuleb kaaluda Aafrika trüpanosoomia diagnoosi.
Unehaiguse esimest etappi on raske diagnoosida, sest see põhjustab mittespetsiifilisi sümptomeid, nagu palavik ja nõrkus. Trypanosoomide otseseks identifitseerimiseks kasutatavad meetodid hõlmavad vereproovide (mustuse või paksu tilga) või lümfisõlme aspiratsiooni valgusmikroskoopia analüüsi. Teised mittespetsiifilised laboritulemused näitavad pancytopeniat, suurenenud VES-i ja PCR-i ning kõrgendatud IgM taset.
Kui parasiit tungib kesknärvisüsteemi ja patsiendid hakkavad ilmnema neuroloogilisi ja psühhiaatrilisi sümptomeid (halb motoorne koordineerimine, desorientatsioon, krambid ja unehäired), nõuab diagnostiline hindamine tserebrospinaalvedeliku analüüsi. Vedeliku kontroll võimaldab isoleerida trüpanosoome ja tõsta esile lümfotsüütide, üldvalkude, IgM märgatava suurenemise ja iseloomulike Mott rakkude (immunoglobuliine sisaldavate tsütoplasmaatiliste vakuoolidega plasma rakud).
