Esimesed Ebola viiruse poolt mõjutatud rakud on nakatunud inimese immuunsuse kaitseks olulised. Mikroorganism takistab eelkõige reaktsiooni käivitumist monotsüütide, makrofaagide ja dendriitrakkude poolt. Reeglina tunnistavad need rakud, et kehasse on jõudnud midagi võõrast, nii et neil on otsustav ülesanne immuunsüsteemi aktiveerimiseks .
Sellest järeldub, et nakkuse tõttu on Ebola viiruse vastu võitlemisel raske välja töötada tõhus reageering, mis võib seega paljuneda keha peamiste organite sissetungimiseks, jättes vähe võimalusi ellujäämiseks.
