Nagu kaariese puhul, on periodontiit ka polümikroobne nakkushaigus. Periodontiumi põletik on tegelikult põhjustatud erinevatest patogeensetest liikidest, mis aitavad kaasa kahjustuste tekitamisele hamba ümbritsevatele kudedele ja tagavad selle mehaanilise stabiilsuse (gingiva, parodondi sidemed ja alveolaarne luu). Aja jooksul põhjustavad periodontopaatiad kollageeni kiudude ja alveolaarse luu hävitavaid kahjustusi, mis põhjustavad hamba langemist.
Suu sees on sadu erinevaid mikroobseid liike; mõned neist on kahjulikud, teised neutraalsed ja teised võivad siiski olla kasulikud (nad on kahjulike liikide leviku vastu). Suukaudse mikroobse taimestiku koosseisu mõjutavad tugevalt toitumine, suuhügieenitase ja geneetilised tegurid.
Periodontiidi päritolu osas on vaja keskenduda nn subgingivaalse naastu mikroobiliikidele. Tegelikult on gingiva vaba serva ja hamba emaili vahele 1–2 mm sügav korg, mida nimetatakse gingivaalseks; mõnes mõttes kujutab see soon endast mingi ökoloogilist niši, väikest tasku, mis pakub kaitset bakterite vastu, mis ei ole hapniku suhtes eriti tolerantsed.
Kui kaariese puhul on peamised kariogeensed mikroorganismid mõned streptokokid (eriti S. mutans ), siis on periodontiidis enamasti kaasatud anaeroobsed gramnegatiivsed bakterid, mida esindavad eelkõige perekonnad Bacteroides ja Fusobacterium .
On kindel, et normaalsetes tingimustes ei erine subgingivaalne naast üllatuslikust naastust ja ainult umbes 12% kultiveeritavast subgingivaalsest taimest koosneb anaeroobsetest ja mikroaerofiilsetest gramnegatiivsetest bakteritest. Siiski, kui suuhügieen on ebapiisav, kipub anaeroobsete liikide osakaal suurenema ja kasvab üha enam, kui igemed põletuvad (gingiviit) ja gingivaalcus süveneb (perifeersete haiguste poolt patoloogiliselt muutunud gingivaalcus muutub kummi tasku nimi).
Periodontiidi peamisteks etioloogilisteks toimeaineteks on Fusobacterium nucleatum, Prevotella intermedia, Porphyromonas gingivalis ja Treponema denticola . Entamoeba gingivalise parasiiti leiti 95% igemehaigustega inimestest ja harva tervete igemete korral.
Tugeva patogeensusega potentsiaalsete mikroorganismide olemasolu ei ole isegi piisav periodontiidi määramiseks. Hamba toetavate kudede põletikku säilitab tegelikult immuunsüsteemi krooniline hüperaktivatsioon, mis ühelt poolt võitleb sissetungijate vastu ja teiselt poolt kahjustab periodontaalseid kudesid. Tegelikult stimuleerivad bakterite hävitamisega vabanevad endotoksiinid osteoklastide aktiivsust, mis vabastavad mõnede vahendajate, kes vastutavad parodondi kudede hävitamise eest.
Sellised tegurid nagu diabeet ja sigarettide suitsetamine suurendavad haigestumise riski, sest nad vähendavad vere (ja hapniku) voolu kummikudedesse, soodustades anerobiliste liikide levikut. Hammaste kuju ja asendi kõrvalised kõrvalekalded, karedad õõnsused, täidised ja väärarengud, sobimatud ortodontilised seadmed ja ebapiisav suuhügieen, suurendavad periodontiidi ohtu, sest need soodustavad naastude kogunemist ja säilitamist.
